不知你的问题解决得怎么样了。问题应该出在LSE电路上，注意选择合适的外部LSE振荡器件与那两个负载电容，让其工作在最稳定的最佳状态。ST有关相关应用笔记 AN2867可以参考下。
STM32L431CCT6芯片，外部使用32.768k的晶振，匹配电容22pf。LSE作为RTC，LPUART1的时钟源，启用LSE CSS功能。经常会发生LSE CSS错误，在发生错误的时候没有任何东西靠近板子，外壳已经封装好了。在发生LSE CSS错误后间隔一定时间（5分钟到半个小时）重新使能LSE，把RTC、LPUART1的时钟源重新配置为LSE（在前面发生LSE CSS错误的时候已经把LSE的时钟源设为LSI，把LPUART1的时钟源设为HSI）好一段时间后又会继续出现LSE错误。 这个错误出现的间隔有长有短，长的几天，短的几分钟。更换匹配电容为6pf的32768晶振和对应的匹配电容，问题依然存在。
