具体要看程序控制来定，如果中断程序运行时间过长，最好是先清，再做其他的。

以STM32F4为例， EXTI外部中断的配置
                        EXTI_Init用来配置一个外部中断
                void EXTI_Init  ( EXTI_InitTypeDef *  EXTI_InitStruct )
                        参数结构体如下:
                        typedef struct
                        {
                          uint32_t EXTI_Line;   //指定要初始化 的外部中断的编号
                                                // EXTI_Line0  EXTI_Line1 .....
                                                //如果有多个需要指定,则可以用 '|'
                          EXTIMode_TypeDef EXTI_Mode;   //指定外部中断的模式
                                                //  EXTI_Mode_Interrupt   中断模式
                                                //  EXTI_Mode_Event       事件模式
                          EXTITrigger_TypeDef EXTI_Trigger; // 指定外部中断线的触发方式,选择上升/下降沿触发
                                                //EXTI_Trigger_Rising = 0x08,  上升沿
                                                //EXTI_Trigger_Falling = 0x0C,  下降沿
                                                //EXTI_Trigger_Rising_Falling = 0x10  双边沿触发
                                                // 上述三个任选一个
                          FunctionalState EXTI_LineCmd;  // 使能或禁止外部中断
                                                //ENABLE   使能
                                                //DISABLE  禁止
                          }EXTI_InitTypeDef;

       
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                        EXTI_ClearFlag 用来清除掉EXTI_Line 指定的中断 pending为,这个函数一般是在中断处理完后调用
                void EXTI_ClearFlag  ( uint32_t  EXTI_Line )