定时中断函数和主函数都会修改这个全局变量。会出现偶尔不是预期的值。

加volatile 修饰 没有用
改大堆栈空 也没有

把定时中断函数的语句放到主函数中运行，就不会出现上面的情况。
有没有大佬能帮助分析一下，或者说一个能解决的这个方法。

简单看了一下你的代码，感觉提取的可能不完善。这段代码的功能应该是判断按键长按的。

除了楼上说的两种可能性：1、观察时间 2、原子操作之外。还有就是你说的A，B和Cnt要加volatile。记得是一定要加的。
你可以试着把：
       B = 1;
       A = 0;
改成：
       A = 0;
       B = 1;
       再试一下

源代码不方便贴出来。贴个简易的代码
u16 A = 0;
u16 B = 0;
u16 cnt = 0;
void main（）
{
  while(1)
{
     if(key == 1)
    {
      A = 1;
      B = 0;
     cnt = 0;
    }
}

}

void timer_handler()  //定时中断函数 10ms 进入一次
{
  if（B == 0）
  {
    cnt ++;
    if(cnt > 500)
    {
      B = 1;
      A = 0;
     cnt = 0;
    }
  }
}

仿真情况下 当松开按键时 会偶尔出现 Ａ＝１　Ｂ＝　１的情况

但是如下操作
u16 A = 0;
u16 B = 0;
u16 cnt = 0;
bit flag_10ms = 0;
void main（）
{
    if(key == 1)
   {
     A = 1;
     B = 0;
     cnt = 0;
   }
  if(flag_10ms ==1)
  {
    flag_10ms = 0;
   if（B == 0）
  {
     cnt ++;
     if(cnt > 500)
     {
       B = 1;
       A = 0;
      cnt = 0;
     }
   }
  }

}

void timer_handler()  //定时中断函数 10ms 进入一次
{
  flag_10ms = 1;
}

就不会 出现 Ａ＝１　Ｂ＝　１的情况

上面贴出来的代码，你自己都知道没有问题，那还为什么要纠结呢？
值是什么，取决于你在什么时候观察，断点在哪。
如果是按键，记得要去抖。如果要好的效果，上升和下降沿都去抖。

初步判断，程序问题

这是安全性问题， 两个或多个线程共享数据都会出现这样的问题， 问题只是慨率多大而已
简单的做法是主函数当数据被读写时屏蔽了中断。

同意edmundlee 高见， 多任务多线程还可将被改的全局变量用互斥量【mutex】来限制同时修改。

网上互斥量【mutex】的资料很多，可依据您的操作系统来使用调整。

这个思路的解决方法，我都尝试了一遍，不行的，现在也不知道问题在哪里，反正放到主函数里面就可以解决了。