在实验过程中发现，将EEPROM的Q（SOMI）与D（SIMO）的两个引脚短路时，主控芯片依旧可以对EEPROM正确读写数据，请问这是什么原理呢？

EEPROM 如果是I2C通讯的话应用用的是SDA和SCL，我理解你用的可能是一个传感器，SOMI和SIMO，这两个是SPI引脚。请详细查看电路图的连接和实际使用。