Linux下命令的一些异常情况

命令不全：在命令没有输入完 (引号或括号没有配对)，就不小心按下了Enter键，终端会提示出一个>代表命令不完整，这是可以继续输入，也可以ctrl+c终止输入，重新再来。(下面sed命令使用时，还有另外一种命令不全的问题)

ct@ehbio:~/ehbio_project$ rename 'ehbio2
>'
) j# `3 V) R$ n5 Cct@ehbio:~/ehbio_project$ rename 'ehbio2
1 r+ m$ D0 p$ o1 }3 _> ^C
ct@ehbio:~/ehbio_project$

文件名输入错误: 多一个字母、少一个字母、大小写问题

ct@ehbio:~/ehbio_project$ls
0 f! D1 U1 [- R2 uehbio2.fa  ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio.fa  second.fa
4 h4 Q0 @% P$ j1 [
# 重命名没有生效
; o9 i8 v2 X1 Sct@ehbio:~/ehbio_project$ rename 'ehbio2' 'ehbio5' ebio2.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
ehbio2.fa  ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio.fa  second.fa
( C9 R6 b1 b8 g& P; X1 }) C8 ?9 ?
# 仔细看是ehbio2.fa写成了ebio2.fa，更正后即可。
Z8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~/ehbio_project$ rename 'ehbio2' 'ehbio5' ehbio2.fa
, `' r8 }0 j+ k1 [3 A+ Qct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
8 y- E& R0 z" X) @" N" `) O# Xehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio.fa  second.fa

所在目录不对: 访问的文件不存在于当前目录，而又没有提供绝对路径, 或软连接失效

ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio6.fa  ehbio.fa  second.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls ../data
9 [$ M8 _  y5 k- r" J, r  U! Mehbio2.fa  first.fa

# 当前目录没有ehbio2.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ less ehbio2.fa
" H& r$ f8 R3 s7 ?* p4 lehbio2.fa: 没有那个文件或目录

1 y1 V3 f: T$ g2 S9 [# ehbio2.fa在上一层目录的data目录下
* M. F0 b# n$ H- B6 ^7 o4 p- Kct@ehbio:~/ehbio_project$ ls ../data/ehbio2.fa
: x" `; u7 h0 h../data/ehbio2.fa

# 加上路径依然访问不了
* O2 [' o/ K- L1 y! ~. {% oct@ehbio:~/ehbio_project$ less ../data/ehbio2.fa
../data/ehbio2.fa: 没有那个文件或目录
; u; _1 o, n. o4 D# ?  |
# 上面的问题是软连接失效，在之前的操作中删掉了原始的ehbio2.fa，所以快捷方式失效
7 Z/ s$ L# G. A. r" r
; K" v, x2 [8 b# 正确的访问
ct@ehbio:~/ehbio_project$ tail -n 3 ../data/first.fa
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
CAGGACAGGAGCTA
' v/ Z; N& \1 {$ K1 U( K7 k& nendLinux终端常用快捷操作

• 命令或文件名自动补全：在输入命令或文件名的前几个字母后，按Tab键，系统会自动补全或提示补全
• 上下箭头：使用上下箭头可以回溯之前的命令，增加命令的重用，减少输入工作量
• !加之前输入过的命令的前几个字母，快速获取前面的命令
  
  4 c/ h& E, o) o& k/ `9 j

ct@ehbio:~/ehbio_project$ cut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4
# ?, A  o: m3 O* b>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
. I0 v4 Y# i; [; o1 OCAGGACAGGAGCTA
* x$ f& ~# |$ N1 q+ Q5 nend
ct@ehbio:~/ehbio_project$ man cut
. @% V. ?; n" O8 g! k/ D0 f# 直接跳到上面运行的cut命令，再执行一次
ct@ehbio:~/ehbio_project$ !cut
  p9 W4 Z: p, `7 W% Ccut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4
>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
: m& X+ D5 B. V4 J* k$ u0 ~CAGGACAGGAGCTA
5 _& s% f* l6 t3 T6 M8 x+ j( Uend

• ctrl+a回到命令的行首，用于修改常命令或注释掉命令
  
  

# 写完下面的命令，突然不想运行了，又不想一个个删掉
ct@ehbio:~/ehbio_project$ cut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4
/ n" I' K6 n7 q3 E: B+ P1 A
# 按ctrl+a, 回到行首，再输入`#`号，回车，命令即被注释掉。
ct@ehbio:~/ehbio_project$ #cut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4

• !! 表示上一条命令。
  
  $ ^; e! m( N: y1 w, h7 F- V& `

ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
) C: s7 ?- \+ w3 R9 I& [! }ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio6.fa  ehbio.fa  second.fa
/ A: U; z" U7 o+ }! Q, e+ L" \ct@ehbio:~/ehbio_project$ !!
1 }# z; k% |9 r& k! l5 qls
% v& T  y4 n( i/ cehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio6.fa  ehbio.fa  second.fa

• 替换上一个命令中的字符，再运行一遍命令，用于需要对多个文件执行同样的命令，又不想写循环的情况
  
  $ i4 Q: ^& j0 |* ^8 J0 [

# 输入一个命令
ct@ehbio:~/ehbio_project$ #cut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4
  `2 `7 G9 p! ?  P/ b
# !!表示上一条命令
6 @1 i  d) D3 s- `# :gs表示替换，把上一个命令中全部的ehbio替换为ehbio3; g: global; s: substitute
ct@ehbio:~/ehbio_project$ !!:gs/ehbio/ehbio3
#cut -f 1 -d ' ' ehbio3.fa | tail -n 4
$ A+ ]" u5 f( M7 J  m
, s7 p# w( j( D( ^# 替换后效果如上
% [. ]0 D+ i% U  v, [
# 去掉命令前的#号
2 p1 u3 f. y1 m* B% b) Rct@ehbio:~/ehbio_project$ cut -f 1 -d ' ' ehbio3.fa | tail -n 4
# t6 I3 |. t( w# a9 R6 d>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
5 Z5 D0 e1 x# @2 E' kCAGGACAGGAGCTA
end

% _) m% Q% `" F## 替换ehbio3为ehbio4，直接运行命令
) K6 D6 p, V; v3 t) c$ gct@ehbio:~/ehbio_project$ !!:gs/ehbio3/ehbio4
cut -f 1 -d ' ' ehbio4.fa | tail -n 4
>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
# l: K0 E' f5 |7 }0 z) hCAGGACAGGAGCTA
3 Z7 _6 E  d$ J. O5 V- ?

end

1 p% Y$ w9 O# K- {