STM32F429ZGT6在调试中程序首先运行HAL_Init函数，在这个函数里面对嘀嗒定时器进行初始化，在使能定时器的中断时，单片机会自动复位，请问是什么情况？

你这怎么探测到对内部flash的擦除？是不是程序分区不对？感觉不是定时器本身的问题。你在每个中断入口打一下断点，看看到底进入了哪里？

从提示内容上看，似乎烧录有点问题。楼主查查optionbyte 是否有异常的设置。