芯片为stm32f103c8t6,电路板安装控制柜内，通过DB9把引出串口1引脚（PA9  PA10）,USB转串口提供如下引脚（VCC   GND   RXD  TXD  RTS  CTS）,如果只用前四个，需要手动跳线BOOT0（0改为1），才能把程序下载到芯片。 我的问题是：在不手动修改BOOT0的状态下，只通过串口，如何升级程序？

那你需要先做一个bootloader呀，通过上电检测或者运行中检测特殊命令进入升级模式呀

通过通讯接口烧录程序有两种方式 1：利用原厂自带的内部程序bootloader，那么需要遵循原厂的协议，上拉boot1引脚复位后与串口通讯升级。 2：不想用原厂的功能，可以自己设计升级程序（IAP），那么启动方式和协议自己制定。注意不要误擦除这段程序就好。

用STM32 IAP吧，网上很多这方面的帖子可以参考